Miałem ostatnio zabawną sytuację gdy kilka serwerów z zainstalowanym NTPD miało rozjazdy rzędu kilkunastu sekund. Wyszło na to że moje serwery synchronizowały się z różnymi zewnętrznymi serwerami NTP pomiędzy, którymi były rozjazdy i te rozjazdy synchronizowały się na moich serwerach. Jeden “z moich” ustanowiłem głównym a wszystkie inne przekierowałem na niego (komentując wszystkie inne serwery NTP w konfiguracji). Wymusiłem synchronizację:

ntp -q

Sprawdziłem jak duży jest offset i jitter (powinny być bardzo małe):

ntpq -p

i tak rzeczywiście było - problem z głowy.

P.S. Jeżeli nie potrzebujemy/chcemy/etc instalować serwera NTP to możemy zamiast tego użyć polecenia ntpdate w cronie (np. co godzinę):

ntpdate moj.serwer.ntp